細(xì)胞色素一類以鐵卟啉（或血紅素）作為輔基的電子傳遞蛋白，廣泛參與動、植物，酵母以及好氧菌、厭氧光合菌等的氧化還原反應(yīng)。細(xì)胞色素作為電子載體傳遞電子的方式是通過其血紅素輔基中鐵原子的還原態(tài)(Fe2+)和氧化態(tài)（Fe3+）之間的可逆變化。任何一類細(xì)胞蛋白（血紅素蛋白），在細(xì)胞能量轉(zhuǎn)移中起著極為重要的作用。細(xì)胞色素可按其吸收的光的波長分為3類，已鑒定出少30種不同的細(xì)胞色素。
卟啉環(huán)以四個(gè)配價(jià)鍵與鐵原子相連，形成四配位體螯合的絡(luò)合物，一般稱為血紅素。根據(jù)血紅素輔基的不同結(jié)構(gòu),可將細(xì)胞色素分為a、b、c和d類。b類細(xì)胞色素的輔基是原血紅素即鐵-原卟啉Ⅸ。卟啉環(huán)上的側(cè)鏈取代基為4 個(gè)甲基,兩個(gè)乙烯基和兩個(gè)丙酸基與血紅蛋白、肌紅蛋白輔基的結(jié)構(gòu)相同。
a類細(xì)胞色素輔基的結(jié)構(gòu)是血紅素A,它與原血紅素的不同是在于卟啉環(huán)的第八位上以甲酰基代替甲基，第二位上以羥代法呢烯基代替乙烯基。
d類細(xì)胞色素僅在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn),它的輔基為鐵二氫卟啉,與其他細(xì)胞色素不同。
c類細(xì)胞色素的輔基是血紅素以其卟啉環(huán)上的乙烯基與蛋白質(zhì)分子中的半胱氨酸巰基相加成的硫醚鍵共價(jià)結(jié)合。其他各類細(xì)胞色素的輔基都是以非共價(jià)鍵與蛋白相結(jié)合。還原狀態(tài)的細(xì)胞色素在可見光區(qū)具有特征性的光吸收帶：α帶、β帶、γ帶(或稱吸收帶)。通常a類細(xì)胞色素的α吸收帶位于598～605納米；b類的大α吸收帶在556～564納米;c類在550～555納米；d類為600～620納米之間。
